System Ninja (Portable) является бесплатной программой для аккуратного и быстрого удаления неиспользуемых файлов с жесткого диска. Одной из особенностей программы является ведение поиска «мусора» по всей файловой системе, а не в определенных местах. Перед сканированием System Ninja дает возможность выбрать, файлы какого типа удалять нельзя (например, сookies). После сканирования программа выдает отчет с результатами проверки, который позволяет пользователю решить дальнейшую судьбу каждого файла, который воспринимается System Ninja как мусор, самостоятельно. Помимо удаления ненужных файлов с жестких дисков, программа предоставляет возможность выполнить также другие необходимые для оптимизации системы действия — удалить «историю» из системного реестра, использовать расширенный менеджер процессов, настроить список автоматически загружаемых программ. Для работы программы необходим Microsoft .NET Framework 3.5.